Una de las características confirmadas de Nintendo 3DS es la posibilidad de actualizar su firmware de forma automática, lo que permitirá a la consola agregar nuevas funcionalidades. Entre las posibilidades que otorgan estas actualizaciones automáticas también se encuentran acciones que permitirán reducir el alto índice de piratería que arrastran históricamente las portátiles de Nintendo. Aunque el propio Satoru Iwata ha advertido que las actualizaciones de funcionalidades tendrán prioridad sobre la prevención de la piratería en la plataforma.
El uso de actualizaciones de firmware para prevenir la piratería no es nada nuevo, ya que todas las consolas de la actual generación disponen de algún sistema similar. Sin embargo esta será la primera portátil de Nintendo que contará con actualizaciones totalmente automatizadas como parte de la “funcionalidad de SpotPass” presentada por Iwata.