La historia comienza cuando el Káiser Oblivion abduce a Agnès Oblige, la heroína de la entrega, y su guardaespaldas, Yew Geneolgia, jura rescatarla del Paraíso del káiser, una fortaleza que flota sobre Eternia. Por el camino, Yew tendrá que formar equipo con Magnolia Arch y otros personajes nuevos, así como con héroes de la anterior entrega como Edea Lee y Tiz Arrior, para superar mazmorras y derrotar a temibles enemigos.

En su lanzamiento, el juego estará disponible en una Edición Coleccionista Deluxe que incluye un CD de la banda sonora original, una figura de Agnès y un libro de ilustraciones con alrededor de 250 páginas. También estará disponible en versión solus y en formato digital, que podrá ser descargada desde Nintendo eShop. Por último, el próximo 11 de febrero estará disponible una demo prelanzamiento a través de Nintendo eShop centrada en los tres paladines del juego -Yew Geneolgia, Janne Angard y Nikolai Nikolanikov–, que servirá de preludio de la aventura y permitirá desbloquear recompensas en la versión completa del juego, dependiendo de cuánto hayan avanzado antes en la demo.

Bravely Second End Layer - Story Trailer